电影《神秘海域》中的彩蛋包括：
无降落伞跳伞
电影开场的运输机大战中，内森被货物撞下运输机，在一长串空投物资包裹中跳跃，最后没有降落伞掉下飞机，通过抓住运输箱，打开降落伞成功降落。这一情节和镜头高度借鉴了游戏《神秘海域3》里经典的一幕，差别在于游戏是一个人在海边跳伞，而电影是埃洛伊配合。
徒手扒飞机
电影开篇，“荷兰弟”饰演的内森·德雷克在高空勇斗匪徒，跑酷般攀爬飞机的紧张动作场面致敬了原版游戏《神秘海域3：德雷克的诡计》的相同桥段。稍有不同的是，在原版游戏里最终飞机会坠毁在沙漠之中，开启一段不同寻常的求生之旅，而在电影里，“荷兰弟”在女主角克洛伊的帮助下顺利逃脱，来到了一个度假小岛上。
童年闪回
影片开头通过闪回的方式交代了主角内森·德雷克的身世背景，讲述了他与哥哥山姆从小一起在孤儿院长大，但最后山姆又离他而去的故事。这也直接致敬了游戏《神秘海域4》里逃出孤儿院的桥段。
拍卖场偷窃
电影中德雷克与苏利文首次搭档偷窃十字架的戏码，同样取材于游戏《神秘海域4》，无论是从双线并行的叙事方式还是两人互损对方的台词，都做到了尽可能的还原。
直升机彩蛋
影片双彩蛋中，两位男主开直升机飞走后，先别着急撤。短字幕和长字幕滚完后，依次各有一个彩蛋。前一个，奈特的哥哥山姆现身，这也与苏利在正片中的“丢下山姆自己跑”的描述相吻合；后一个，奈特戴在脖子里的戒指似乎暗藏玄机，某帮派大佬重金收购，苏利即时出现解救奈特，二人却仍未能逃脱。这也暗示着，《神秘海域》极有可能出续集。
这些彩蛋不仅增加了电影的趣味性和深度，也让游戏迷们感到亲切和兴奋。建议观众在观看电影时留意这些细节，以获得更完整的观影体验。
